Η κύρια υδρολογική λεκάνη του Υδατικού Διαμερίσματος Θεσσαλίας είναι η λεκάνη του Πηνειού, με έκταση περίπου 9.500 km2. Κυριότεροι παραπόταμοι του Πηνειού είναι προς τα νότια ο Ενιπέας, ο Φαρσαλιώτης, ο Σοφαδίτης και ο Καλέντζης, προς τα δυτικά-νοτιοδυτικά ο Πάμισος, και ο Πορταϊκός, και στο βόρειο μέρος ο Ληθαίος, ο Νεοχωρίτης και ο Τιταρήσιος. 

Τα τελευταία 25 χρόνια, οι εργασίες στα έργα του Άνω Αχελώου διακόπηκαν πολλές φορές, εξαιτίας της εμπλοκής του Σ.τ.Ε.

Τα σημαντικά προβλήματα που αντιμετωπίζει η Θεσσαλία σε όλα τα επίπεδα της διαχείρισης των υδατικών πόρων, πρέπει να αντιμετωπισθούν στα πλαίσια μιας εθνικής υδατικής πολιτικής, που θα στηρίζεται κυρίως στις αρχές της Οδηγίας πλαίσιο 2000/60 για το νερό, για την υλοποίηση - εφαρμογή της οποίας υπήρξαν σημαντικές καθυστερήσεις με ευθύνη της Πολιτείας.

Σύσκεψη και κοινή ανακοίνωση για προσφυγή στο Στε στα πλαίσια κατάθεσης αίτησης ακυρώσεως κατά της απόφασης του προέδρου της Εθνικής Επιτροπής Υδάτων με την οποία εγκρίθηκε το Σχέδιο Διαχείρισης Λεκανών απορροής Ποταμών του Υδάτινου Διαμερίσματος Θεσσαλίας.